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在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后，第九、十使徒相继降临，真嗣他们面临着生与死的残酷考验……。四位驻伊美军士兵接到了回国的调令，然而，一次恐怖性炸弹袭击，改变了他们的命运。军用卡车司机凡妮莎（杰西卡•贝尔 Jessica Biel 饰）被炸成重伤，军医威尔（塞缪尔•杰克逊 Samuel L. Jackson 饰）负责救治，结果不幸截肢。贾马尔（50美分50 Cent 饰）误杀了伊拉克妇女，从此存下心结。汤米（布莱恩•普莱斯列 Brian Presley 饰）亲眼目睹了战友阵亡，悲痛欲绝。四个人回国后，凡妮莎在校园做体育老师，但是配搭的假肢让她黯然神伤。威尔的妻子发现丈夫的情绪总是失控，而叛逆的儿子也经常顶撞父亲；贾马尔和汤米同时进行了心理诊疗小组，但是两人发生争执，分道扬镳，没想到再次见面却是生死一线……。